黄河鲤新品系在养殖过程中的水质微生物菌群结构的动力学变化【字数：10456】
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言4
1□材料与方法4
1.1□材料 4
1.2(DNA提取和16s扩增子测序4
1.3(测序结果分析4
1.4(数据分析4
2□结果与分析4
2.1□经过两个月养殖期的生长性能变化4
2.2□高通量测序数据统计和优化5
2.3□序列丰度和α多样性分析8
2.4□菌落的组成分析9
2.5□养殖水体细菌菌落差异性分析9
3□讨论 10
3.1□不同时间内的水质菌落动态变化10
2.4□黄河鲤新品系与水质环境的关系10
致谢10
参考文献11
养殖过程中水质微生物动力学变化对黄河鲤新品系肠道微生物结构的影响
摘 要
为了了解黄河鲤新品系养殖过程中肠道微生物结构与水体微生物之间的相互关系，本研究通过动态分析黄河鲤新品系养殖2个月的水质微生物菌落组成变化，以及这些变化与黄河鲤新品系养殖结束时肠道微生物菌群结构来获取它们之间的内在关联。针对此，本文分别采集黄河鲤新品系不同养殖周期的水质样本和试验结束时黄河鲤新品系肠道样本，经过细菌16s rRNA V3V4可变区扩增和Illumina高通量测序，并对水质样本微生物的多样性和差异性分析。 结果发现通过有效序列的OTU种数和稀释曲线分析，样品测序丰度达到了分析的质量要求。水质样本的Chao1指数、香农指数(Shannon)和辛普森指数(Simpson)均比黄河鲤新品系肠道微生物要高。在细菌群落的组成上，水质样本的细菌组成和丰富度也是随着时间的改变而发生变化的，水质中的优势菌门基本稳定为变形菌门和放线菌门。不同养殖周期的水质样本中，细菌菌落的优势菌没有差异，但是细菌的组成和丰富度存在明显差异。PCA 结果分析表明与底泥样本相比，黄河鲤新品系肠道样本与池塘水质样本尤其在养殖后期的水质样本相似度更高。这说明水质比底泥更容易影响黄河鲤新品系的肠道菌群结构，这些将为黄河鲤新品系配套良法的建立提供参考。
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