目录
摘要1
关键词1
Abstract2
Key words2
引言3
1材料与方法5
1.1实验材料 5
1.1.1水稻种质材料和目标性状的选择5
1.1.2稻瘟病菌和培养基5
1.2方法 6
1.2.1稻瘟病菌活化与产孢培养6
1.2.2关联群体的构建6
1.2.3水稻的播种与苗瘟接种6
1.2.4苗瘟等级统计6
1.2.5全基因组关联分析7
2结果与分析8
2.1水稻群体表型统计与分析8
2.2苗瘟表型的GWAS分析10
2.3候选基因的获得与单倍型分析13
3讨论 17
致谢19
参考文献19
图21 两次苗瘟实验的表型统计9
图22 两次苗瘟实验结果的关联分析11
图23 关联位点的LD热图分析14
图24 候选基因的单倍型分析15
表21 2019年6月苗瘟获得的关联位点12
表22 2019年10月苗瘟获得的关联位点12
表23 两次苗瘟实验共同定位到的位点13
表24 获得的候选基因信息16水稻自然群体苗瘟抗性的GWAS分析
摘 要
水稻作为最重要的粮食作物是世界上一半以上人口的主粮，水稻易受病虫害侵染，其中稻瘟病是危害水稻生产的三大病害之一。由于稻瘟病菌生理小种容易发生突变，水稻对稻瘟病抗性容易丧失，因此，使用稻瘟病抗性基因来预防和控制稻瘟病是一种经济、有效和安全的方法。在鉴定抗病基因过程中，全基因组关联分析方法也为基因挖掘提供了新的方法和策略，从而缩短育种年限和实验时间。本研究以来自康奈尔的413份水稻种质资源为材料进行苗瘟接种实验，从中筛选出240份具有代表性的水稻品种，利用全基因组关联分析方法获得与稻瘟病抗性相关的显著性标记。表型数据通过计算机整理后制作曼哈顿图，两次实验最终筛选出重复的4个关联位点，通过单倍型分析检测到18个候选基因信息，帮助后续进行转基因验证，为广谱抗病育种提供了 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ￥351916072￥ 
重要理论依据。本次实验利用的全基因组关联分析方法在作物遗传育种中的应用越来越广泛，势必加快我国作物育种的研究进程，提高优良基因作物的研发效率，实现我国种质资源优势向基因资源优势的转变。

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