瑞士乳杆菌胞外多糖基因簇定位及生物信息学分析【字数:8583】
目录
摘要1
关键词1
Abstract2
Key words2
引言3
1 综述3
2 材料与方法6
2.1 实验材料6
2.1.1 已获得的实验材料6
2.1.2 所使用的实验器材6
2.2 实验方法6
3 实验结果7
3.1 基因簇的位置7
3.2 进化树11
3.3 MEME motif11
4 分析与讨论12
致谢14
参考文献14
瑞士乳杆菌胞外多糖基因簇定位及生物信息学分析
摘 要
本论文通过在NCBI中下载瑞士乳杆菌FAM8627、FAM22155、IDCC3801、LH99及MB21现有的包含注释的序列信息,经过与现有菌株胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)基因簇信息进行查找比对,确定了其胞外多糖基因簇位置及其包含基因的注释。其中瑞士乳杆菌FAM8627的EPS 基因簇包含20个基因,瑞士乳杆菌FAM22155的EPS基因簇包含18个基因,瑞士乳杆菌IDCC3801的EPS基因簇包含13个基因,瑞士乳杆菌LH99的EPS基因簇包含19个基因,瑞士乳杆菌MB21的EPS基因簇包含13个基因。并通过蛋白同源比对确定了基因的功能及其家族,绘制了MEME motif图,并对基因进行了核苷酸多序列比对,确定了保守碱基序列。目的在于了解瑞士乳杆菌EPS基因簇的保守序列,通过生物信息学分析确定未知序列瑞士乳杆菌胞外多糖基因簇的定位方法,为瑞士乳杆菌胞外多糖基因簇的研究奠定了进一步的基础。
原文链接:http://www.jxszl.com/swgc/spzlyaq/606664.html