大白猪tgfβ1基因intron4多态性与繁殖性能的关系【字数:12154】
目录
摘 要 I
ABSTRACT II
第一章 文献综述 1
1 TGFβ1基因研究进展 1
1.1 TGFβ1定位 1
1.2 TGFβ1信号通路 1
1.3 TGFβ1与雌性动物生殖有关的生物学功能 2
1.4 TGFβ1与哺乳动物繁殖性能的关系 4
2 内含子碱基突变的研究进展 5
2.1 内含子碱基突变对mRNA剪切的影响 5
2.2 内含子碱基突变对miRNA的影响 6
2.3 内含子碱基突变对转录因子结合位点变化的影响 6
3 研究目的及意义 6
第二章 试验部分 7
1 材料与方法 7
1.1 试验动物 7
1.2 试验仪器 8
1.3 试验试剂 8
1.4 DNA提取 8
1.5 引物设计 8
1.6 PCR扩增 9
1.7 凝胶电泳 9
1.8 RNA提取 9
1.9 反转录 10
1.10 cDNA扩增 10
1.11 SNP筛选及分型 11
1.12 数据分析 11
2 结果与分析 11
2.1 大白猪TGFβ1基因第4内含子PCR扩增 11
2.2 大白猪TGFβ1基因第4内含序列分析 12
2.2 大白猪TGFβ1基因第4内含子突变位点的筛选 13
2.4 大白猪TGFβ1基因g.8666_8667delAC位点多态性分析 14
2.5 大白猪TGFβ1第4内含子多态性与繁殖性能关联分析 16
2.6 大白猪TGFβ1第4内含子不同基因型对其mRNA剪接的影响 16
3 讨 论 17
第三章 结论与展望 19
1 结论 19
2 存在的不足 19
3 后续展望 19
参考文献 20
致 谢 23
大白猪TGFβ1基因intron 4多态性与繁殖 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ^351916072*
性能的关系
摘 要
转化生长因子β1(Transforming growth factorβ1, TGFβ1)是TGFβ超家族的一员,在哺乳动物体内发挥着多重作用。研究发现TGFβ1及其受体广泛存在于雌性动物的多种生殖器官和细胞中,可以作用于这些器官和细胞从而影响雌性动物生殖和繁殖性能,例如卵泡的发育、排卵、黄体形成、受精和妊娠等过程。为了解TGFβ1基因与母猪繁殖性能的关系,本文采用PCR扩增和测序技术鉴定大白猪TGFβ1基因第4内含子(intron 4)全序列,利用池DNA测序技术筛选突变位点,利用SAS软件线性模型分析突变位点多态性与母猪繁殖性状的关联性,以及突变影响繁殖性能的可能机制。结果发现大白猪TGFβ1基因intron 4序列全长为189 bp,含有一个微卫星(GT)6和多个顺式作用元件,一致性分析发现其与杜洛克猪相应序列的一致性为98.94%。利用大白猪DNA池(n=20)进行测序发现,在intron 4的6364核苷酸(nt)处(即TGFβ1基因的8666 nt~8667 nt处)存在一个2 bp序列的插入/缺失突变,命名为g.8666_8667delAC。在大白猪群体中,g.8666_8667delAC位点存在3种基因型(ins/ins、ins/del和del/del),其中ins/ins为优势基因型(57.8%)。关联分析发现,ins/del基因型母猪的初产死胎数(NSB)显著高于ins/ins基因型和del/del基因型;del/del基因型母猪的总产仔数(TNB)比ins/ins基因型和ins/del基因型分别高0.47头和0.46头,但差异不显著。另外,克隆测序发现ins/ins基因型和ins/del基因型母猪卵巢颗粒细胞TGFβ1基因编码区序列长度一致。综上,TGFβ1基因是大白猪繁殖性状的候选基因,g.86668667delAC位点突变不是通过影响TGFβ1基因的选择性剪接来影响繁殖性能的。
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