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老鸦瓣myb基因克隆及表达分析【字数:5496】

2024-11-03 13:13编辑: www.jxszl.com景先生毕设
MYB转录因子在植物生长发育过程中起着重要的调控作用。为了揭示MYB类转录因子TeMYB91在老鸦瓣芽茎发育过程中的生物学功能,基于三代全长转录组数据设计引物,克隆待研究老鸦瓣MYB转录因子,利用在线网站和相关软件对目的基因进行生物信息学分析和预测,应用RT-PCR技术分析目的基因在老鸦瓣不同组织和芽茎三个发育时期的表达模式。结果显示,通过克隆获得老鸦瓣R2-R3类MYB基因,将其命名为TeMYB91,其开放阅读框为全长为1109bp,编码348个氨基酸,表达分析表明TeMYB91具有明显的差异表达特性,在芽茎形成初期的表达量最高,推测其可能主要在芽茎发育时期发挥作用。老鸦瓣芽茎MYB基因的理化性质、结构、功能以及特异性表达分析可为进一步探究其生物学功能提供依据。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1 材料与方法 2
1.1 材料 2
1.2 方法 2
1.2.1 总RNA提取 2
1.2.2 RNA的反转录及cDNA的获得 2
1.2.3 目的基因的克隆 3
1.2.4 中间载体的构建 3
1.2.5 转化 3
1.2.6 菌落PCR鉴定 3
1.2.7 生物信息学分析 4
1.2.8 TeMYB91基因的组织表达特异性分析 4
2 结果与分析 5
2.1 TeMYB91基因的克隆 5
2.2 TeMYB91的生物信息学分析 5
2.3 TeMYB91基因的组织表达特异性分析 7
3 讨论 8
致谢 8
参考文献 8
老鸦瓣MYB基因克隆及表达分析
学 生 王 娴
引言
MYB是植物中最大的转录因子家族之一[1],广泛参与植物各器官的生长发育[2]。但目前关于MYB转录因子的研究在农作物方面较多,对药用植物方面的研究还相对较少。
老鸦瓣Amana edulis(Miq.)Baker是百合科(Liliaceae) 老 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: #351916072
鸦瓣属(Amana)植物,它的干燥鳞茎是中药光慈姑。光慈姑味甘,性寒,有毒,具有行血化瘀、解毒散结的疗效[3]。根据植物志记载及实际调查结果,其主要分布于安徽、江苏、浙江等地[4]。近年来随着药用价值的开发,对光慈姑药材需求量剧增,光慈姑在临床上的应用越来越广泛,但老鸦瓣资源短缺,亟待开展老鸦瓣的人工栽培技术研究[5]。目前该研究刚刚起步,对老鸦瓣生长发育规律等方面的研究尚不清楚,尤其了解老鸦瓣芽茎发生机理对于其产业化栽培具有重要意义,其中MYB基因方面的研究几乎还是空白,有较大研究空间[6]。
近年来,随着生物技术的发展,研究发现的MYB类转录因子功能趋于多样化,在植物的生长发育过程中起到不可缺少的重要作用。但相关研究在药用植物领域相对较少,仍有大量空白领域等待探索[7]。老鸦瓣是重要的中药资源,具有较大的药用价值,面对资源短缺而市场加大需求的现状,探索其芽茎生长机理具有重要作用。前期研究表明,MYB转录因子可能在老鸦瓣芽茎发生过程中具有重要作用。因此,本研究开展老鸦瓣MYB基因克隆及表达分析,以期初步阐明MYB转录因子在老鸦瓣芽茎发生过程中的作用机理,以便能为产业化栽培提供依据,更好的发挥作用满足市场所需[8]。
1 材料与方法
材料
供试材料采于江苏省大学大棚,经郭巧生教授鉴定,为老鸦瓣A. edulis。于2020年1月收集健康植株的实验材料,包括老鸦瓣芽茎形成前期(T1,栽种后41d)、中期(T2,栽种后50d)、后期(T3,栽种后60d) 、鳞茎、叶、花,每一部位随机选取发育一致的样本(1015个),在液氮中速冻(80℃条件下)保存用于RNA的提取。
中间克隆载体p EASYBlunt,荧光定量PCR试剂盒,植物总RNA提取试剂盒、
cDNA反转录试剂盒,感受态大肠杆菌DH5a、胶回收试剂盒。
1.2 方法
1.2.1 总RNA提取
将冷冻后的老鸦瓣芽茎组织,放置于冲洗干净的研钵中,加入一定量的液氮,快速研磨样品,将样品磨成粉末状后,放入EP管(经液氮预冷)中[9],提取各样品的总RNA(利用植物RNA提取试剂盒),随后进行各样品的纯度检测(于1%琼脂糖凝胶电泳中),进行RNA的纯度检测(利用紫外分光光度计),稀释合成的cDNA(按1:5的比例),后于20 ℃条件下保存备用[10]。
1.2.2 RNA的反转录及 cDNA 的获得
获得的RNA浓度检测合格之后,将总RNA反转录成cDNA(参考TaKaRa反转录试剂盒)。
(1)在一容器里冰上nucleasefree,然后按照表1中的添加量将试剂均匀混合;
(2)将以下试剂按顺序加入 1)中所获得的混合物里;
表1 cDNA 合成第一步混合的试剂
Table 1 Reagents mixed in the first step of cDNA synthesis
试剂
添加量
RNA 模板
1μg2μg
nucleasefree water
to 12μl
Primer
1μl
将表2中的试剂均匀混合并进行离心操作;
表2 cDNA 合成第二步混合的试剂
Table 2 Mixed reagents in the second step of cDNA synthesis
试剂
添加量
10m M dNTP Mix
2μl
RevertAid MMuLV RT(200U/μl)

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